Транскраниальная магнитная стимуляция – неинвазивный способ исследования центральной и периферической нервной системы. В основе метода лежит принцип электромагнитной индукции, при котором стимулятор генерирует магнитное поле, которое практически без потерь проникает через кости черепа и, в свою очередь, на небольшой глубине генерирует электрическое поле, которое собственно и «активирует» нейроны коры.  Метод безболезненный и безопасный. В результате возбуждения корковых нейронов возникают распространяющие импульсы по проводящим нервным путям, которые достигают, в частности, мышц конечностей с возможностью их регистрации специальным оборудованием. Другое название метода – моторные вызванные потенциалы. В отличие от традиционных вызванных потенциалов, которые исследуют только проведение по восходящим, чувствительным путям, транскраниальная магнитная стимуляция впервые позволила исследовать функцию и состояние проведения в обратном направлении – от коры головного мозга «вниз» по двигательным путям.

Оборудование состоит из двух частей – магнитного стимулятора и регистрирующего устройства (электромиографа), которые синхронизированы. Стимул подается через специальный зонд (койл), который располагается непосредственно над скальпом. В зависимости от задач регистрирующие электроды располагаются на мышцах верхних или нижних конечностей, или иных участках тела. После каждого стимула регистрируется мышечный (моторный) ответ, который возникает через 20-40 миллисекунд после стимула (в зависимости от места регистрации, времени проведения импульса от коры до мышцы). Врач измеряет время проведения, амплитуду ответа. Эти данные позволяют оценить состояние центральных отделов двигательных путей, получить информацию, недоступную классическими методами электромиографии.

В последние годы значительное внимание уделяется исследованию терапевтического эффекта  так называемой ритмической транскраниальной магнитной стимуляции.